Управление Федеральной налоговой службы по Алтайскому краю является территориальным органом ФНС России и входит в единую централизованную систему налоговых органов. На сегодняшний день в структуру Управления входят четыре межрайонные инспекции, обеспечивающие контроль на всей территории региона.
Основная задача ведомства — комплексное и оперативное решение вопросов налогоплательщиков непосредственно и во взаимодействии с органами власти края. Управление осуществляет контроль за соблюдением законодательства о налогах и сборах, правильностью исчисления и своевременностью уплаты налогов, сборов и страховых взносов в бюджетную систему Российской Федерации, ведет учет организаций и физических лиц, представляет сведения из государственных реестров (ЕГРЮЛ, ЕГРИП, ЕГРН), бесплатно информирует граждан об их правах и обязанностях, рассматривает жалобы на действия должностных лиц, обеспечивает возврат излишне уплаченных сумм, а также выполняет функции главного администратора доходов бюджета Алтайского края и местных бюджетов.